The inherited bone marrow diseases (IBMD) are a diverse group of diseases featuring single or multi-lineage cytopaenias and numerous potential associated manifestations including multi-organ syndromic features, a predisposition to haematological malignancy and/or a bleeding phenotype. This panel is appropriate to be used for the following phenotypes of IBMD : - Fanconi anaemia (excluding BRCA1, BRCA2, BRIP1 due to their more common association with familial breast cancer risk than FA) - Diamond-Blackfan anaemia - Dyskeratosis congenita / telomere biology disorders - Shwachman-Diamond syndrome - Severe congenital neutropenia - Thrombocytopenia-absent radius syndrome - Congenital amegakaryocytic thrombocytopenia - Adenosine deaminase deficiency - GATA2 deficiency syndrome - SAMD9 / SAMD9L related disorders - Congenital dyserythropoietic anaemia - Congenital sideroblastic anaemia - Bernard-Soulier syndrome This panel is being used in the IBMDx study (NCT05196789) – “Diagnosis, discovery and novel phenotype characterisation using multimodal genomics in patients with inherited bone marrow failure and related disorders” Some heritable diseases associated with cytopaenias and/or bleeding (for example thalassaemia/haemoglobinopathies and haemophilia) are not assessed with this panel.
Kristin Rigbye (Victorian Clinical Genetics Services)
vahid pazhakh (Peter MacCallum Cancer Centre)
Ain Roesley (Victorian Clinical Genetics Services)
Bryony Thompson (Royal Melbourne Hospital)
Zornitza Stark (Victorian Clinical Genetics Services; Australian Genomics)
Santosh Varughese (University of Melbourne)
List | Entity | Reviews | Mode of inheritance | Details | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Green List (high evidence) |
ABCB7 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
ACTN1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
ADA2 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
ADH5 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
AK2 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
ALAS2 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
ANKRD26 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
C15orf41 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
CDAN1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
CDC42 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
CSF3R |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
CTC1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Green List (high evidence) |
CXCR4 |
2 reviews1 green |
MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
CYCS |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
DDX41 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
DIAPH1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
DKC1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
DNAJC21 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
EFL1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
ELANE |
1 review1 green |
MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
ERCC4 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
ERCC6L2 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
ETV6 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
FANCA |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
FANCB |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
FANCC |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
FANCD2 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
FANCE |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
FANCF |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
FANCG |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
FANCI |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
FANCL |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
FLI1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
G6PC3 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
GATA1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
GATA2 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
GFI1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Green List (high evidence) |
GFI1B |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
GLRX5 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
GP1BA |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
GP1BB |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
GP9 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
HAX1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
HOXA11 |
1 review |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
ITGA2B |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
ITGB3 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
JAGN1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
KLF1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
LIG4 |
2 reviews2 green |
BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
LYST |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Green List (high evidence) |
MECOM |
3 reviews3 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
MPL |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
MYH9 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
MYSM1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
NBEAL2 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
NHP2 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
PALB2 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
PARN |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
PUS1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RAD51C |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RBM8A |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RPA1 |
1 review1 green |
MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted |
Sources
Phenotypes
Tags |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Green List (high evidence) |
RPL11 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RPL15 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RPL31 |
1 review |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RPL35A |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RPL5 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Green List (high evidence) |
RPL9 |
1 review |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RPS10 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RPS17 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RPS19 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Green List (high evidence) |
RPS20 |
2 reviews |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Green List (high evidence) |
RPS24 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RPS26 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Green List (high evidence) |
RPS27 |
2 reviews1 red |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RPS29 |
1 review |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RPS7 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RTEL1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
RUNX1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
SAMD9 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
SAMD9L |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
SBDS |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
SEC23B |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
SLC19A2 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
SLC25A38 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
SLX4 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
SRP54 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
TERC |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
TERT |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
THPO |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
TINF2 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
UBE2T |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
VPS45 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
WAS |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Green List (high evidence) |
WIPF1 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
WRAP53 |
1 review1 green |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Green List (high evidence) |
XRCC2 |
1 review |
Unknown |
Sources
Phenotypes
Tags |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amber List (moderate evidence) |
FANCM |
2 reviews1 red |
BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal |
Sources
Phenotypes
Tags |
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Amber List (moderate evidence) |
RPL26 |
2 reviews1 red |
MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted |
Sources
Phenotypes
Tags |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amber List (moderate evidence) |
RPL27 |
2 reviews1 red |
MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted |
Sources
Phenotypes
Tags |